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Enregistrement W2049838525 · doi:10.1080/09291016.2011.614795

Genetic variation in the circadian rhythm genes, <i>clock</i> and <i>clif</i> , and possible association with coronary artery disease in individuals of Chinese Han descent

2011· article· en· W2049838525 sur OpenAlexaff
C. Chen, Zhou Jiang, Shuting Cheng, Yan Zou, Yanlin Liu, Yuanyuan Wang, Jing Xiao, Huili Guo, Scott J. Tebbutt, Zhanqi Wang

Notice bibliographique

RevueBiological Rhythm Research · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueCircadian rhythm and melatonin
Établissements canadiensSt. Paul's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologySingle-nucleotide polymorphismCLOCKCircadian rhythmCircadian clockGeneInternal medicineEndocrinologyGeneticsGenotypeMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Clock is a core, well-established, circadian gene, and clif is a newly discovered circadian gene, both of which not only maintain the circadian rhythm of cells but also regulate some organic functions. The purpose of this study was to determine whether genetic variations (single nucleotide polymorphisms – SNPs) in clock and/or clif genes associate with coronary artery disease (CAD). We silenced the clock and clif genes in cells and mice. The mRNA levels of clock, clif, pai-1, and tm of mice were examined using Reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). Plasminogen activator inhibitor 1 (PAI-1) and thrombomodulin (TM) levels will be examined using enzyme-linked immunosorbent assay. The clock SNPs (rs3840267, rs3749474, and rs1402963), and clif SNPs (rs62758860 and rs2289709) were analyzed in 116 patients with CAD and 95 healthy controls by sequence-specific primer-polymerase chain reaction. Data were analyzed by χ2 analysis. The mRNA levels of pai-1 and tm was decreased in the clock or clif gene silenced groups, and their protein levels were accordingly decreased. The blood serum PAI-1 and TM levels were significantly lower in CAD patients than that in healthy control. There showed significant association between clock SNPs (rs3840267) and CAD. And there was no significant association between clock SNPs (rs3749474 and rs1402963), clif SNPs (rs62758860 and rs2289709) and CAD. The data support an association between clock/clif and CAD. The clock SNPs (rs3840267) is associated with CAD. The clock gene could influence the expressions of PAI-1and TM in both cell and mice, and the blood levels had differences of PAI-1 and TM between CAD human recruitments and health controls. The process of PAI-1/TM influencing CAD may be under control by clock and clif gene.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,423

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,069
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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