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Enregistrement W2049848204 · doi:10.1136/jmg.40.3.e22

The <i>RNASEL</i> 471delAAAG allele and prostate cancer in Ashkenazi Jewish men

2003· letter· en· W2049848204 sur OpenAlexafffund
K Kotar

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Genetics · 2003
Typeletter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Treatment and Research
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General HospitalMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesMcGill University
Mots-clésProstate cancerLoss of heterozygosityAlleleLocus (genetics)CancerProstateBiologyGeneticsOncologyMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

There is compelling evidence that genetic factors play an important role in prostate cancer, but no unequivocally disease causing mutations in prostate cancer susceptibility genes have been identified. In 2002, Carpten et al 1 reported that variants in the gene RNASEL were present in some multiple case prostate cancer families. RNASEL maps to the region of chromosome 1q that has been linked to prostate cancer in multiple case prostate cancer families2 and this locus is often referred to as HPC1 . In particular, a truncating variant, E265X, was identified in a single kindred with several cases of prostate cancer and functional analysis and the presence of loss of heterozygosity at markers close to RNASEL in one tumour supported a putative pathogenic role for this variant. However, subsequent publications have questioned the biological significance of truncating and missense variants in this gene3 ,4 and its true importance in determining prostate cancer risk remains uncertain. Rennert et al 5 recently identified a variant in RNASEL , known as 471delAAAG, in an Ashkenazi Jewish (AJ) man who was diagnosed with prostate cancer at the age of 65. Notably, his brother was also affected with prostate cancer at the age of 57 and was found to be homozygous for this variant. The authors then looked for this variant in 119 Israeli men with prostate cancer, among whom 87 were of AJ origin. They identified six men who carried this variant, all among the AJ males (6.9%, 95% confidence interval (CI) 2.6 to 14.4). Lower frequencies were found among elderly AJ without prostate cancer (2/83, 2.4%, 95% CI 0.29 to 8.4) and among young AJ females (6/150, 4.0%, 95% CI 1.5 to 8.5). No variants were identified in non-AJ subjects with or without prostate cancer. Limited haplotype studies indicate that the variant …

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,331
Écart entre enseignants0,311 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2003
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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