Crossing the borders: Poly(A)-binding proteins working on both sides of the fence
Notice bibliographique
Résumé
The addition of a 3' poly(A) tail is a pre-requisite for the maturation of the majority of eukaryotic transcripts. In most eukaryotic species, RNA poly(A) tails are bound by two important poly(A)-binding proteins (PABPs): PABPC1 and PABPN1 that localize to the cytoplasm and the nucleus, respectively. Such steady state localization for PABPN1 and PABPC1 led to a model whereby PABPN1-bound nuclear mRNAs are remodeled during or after nuclear export so that PABPN1 is replaced by PABPC1 to allow robust cap-dependent translation in the cytoplasm. Here we discuss evidence that challenge the view in which PABPN1 and PABPC1 function solely in the nucleus and cytoplasm, respectively. We discuss accumulating evidence that support nuclear roles for PABPC1 in mRNA biogenesis as well as cytoplasmic roles for PABPN1 in translational control. Because 3' poly(A) tails can also act as a degradation mark via the exosome complex of 3'-5' exonucleases, we also discuss recent results that involve the nuclear PABP in posttranscriptional gene regulation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,005 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».