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Enregistrement W2049868029 · doi:10.1063/1.1361073

Dynamics of the water-catalyzed phototautomerization of 7-azaindole

2001· article· en· W2049868029 sur OpenAlexaff
Antonio Fernández‐Ramos, Zorka Smedarchina, Willem Siebrand, Marek Z. Zgierski

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Chemical Physics · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiquePhotochemistry and Electron Transfer Studies
Établissements canadiensSteacie Institute for Molecular Sciences
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryTautomerReaction rate constantExcited stateDielectricProtonMoleculePotential energy surfaceSinglet stateAb initioAqueous solutionSupermoleculeAtomic physicsPhysical chemistryPhysicsQuantum mechanicsKinetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Multidimensional ab initio proton tunneling rate constants are reported for the tautomerization of singlet-excited 7-azaindole complexed with water, represented by discrete water molecules with and without a dielectric continuum. The results are compared with experimental observations in cold beams and in room-temperature aqueous solutions. For complexes with one and two water molecules, potential-energy surfaces are calculated at the complete active space multiconfiguration self-consistent-field [CASSCF(8,8)] level. For comparison with solution data, the structures are reoptimized inside a spherical cavity according to the Onsager model. To compare the effect of the dielectric with that of a secondary solvent shell, the structure of 1:1 and 1:2 complexes solvated by four and three additional water molecules so as to form 1:5 complexes, are optimized at the CASSCF(8,8) level with single-point Onsager corrections. Based on these potential-energy surfaces, temperature-dependent multidimensional proton transfer rate constants are calculated with a recently developed version of the instanton approach. It is found that in gas-phase 1:1 and 1:2 complexes tautomerization occurs through concerted double and triple proton transfer, respectively. The calculated low-temperature rate constants agree with the observation that in these complexes no tautomerization occurs within the fluorescence lifetime of about 8 ns. Addition of a dielectric continuum within the Onsager model cannot explain the room-temperature rate constant of about 1010 s−1 observed as the fast tautomerization component of excited 7-azaindole in protic solutions. Addition of a secondary solvent shell of four water molecules to the 1:1 complex has only a minor effect on the proton transfer rate, but addition of a secondary shell of three water molecules to the cyclic 1:2 complex yields rate constants of the observed order of magnitude. This happens because the double bridge facilitates charge separation, which stabilizes an ion-pair structure for the transition state. As a result the barrier is lowered drastically and although the proton effective mass is also increased, the effect of the lower barrier dominates, leading to much faster proton transfer. It is concluded that the fast rate component observed in room-temperature tautomerization of excited 7-azaindole in water and alcohols corresponds to proton transfer through a bridge of two hydrogen-bonded water molecules, rather than through a single-molecule water bridge as previously assumed. The predicted mechanism involves a (meta)stable intermediate state.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations48
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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