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Enregistrement W2049894993 · doi:10.1021/ja058254d

Expression, Purification, and Characterization of a Galactofuranosyltransferase Involved in <i>Mycobacterium t</i> <i>uberculosis</i> Arabinogalactan Biosynthesis

2006· article· en· W2049894993 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Chemical Society · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueCarbohydrate Chemistry and Synthesis
Établissements canadiensAlberta Glycomics CentreUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious Diseases
Mots-clésChemistryOligosaccharideBiochemistryArabinogalactanEnzymeStereochemistryGlycoconjugateBiosynthesisGlycobiologyDisaccharideGlycosyltransferaseGalactanEscherichia coliCell wallGlycanGlycoproteinGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The major structural component of the cell wall of Mycobacterium tuberculosis is a lipidated polysaccharide, the mycoyl-arabinogalactan-peptidoglycan (mAGP) complex. This glycoconjugate plays a key role in the survival of the organism, and thus, enzymes involved in its biosynthesis have attracted attention as sites for drug action. At the core of the mAGP is a galactan composed of D-galactofuranose residues attached via alternating beta-(1-->5) and beta-(1-->6) linkages. A single enzyme, glfT, has been shown to synthesize both glycosidic linkages. We report here the first high-level expression and purification of glfT by expression of the Rv3808c gene in Escherichia coli C41(DE3). Following a three-step purification procedure, 3-7 mg of protein of >95% purity was isolated from each liter of culture. We subsequently probed the substrate specificity of glfT by evaluating a panel of potential mono- and oligosaccharide substrates and demonstrated, for the first time, that trisaccharides are better substrates than disaccharides and that one disaccharide, in which the terminal D-galactofuranose residue is replaced with an L-arabinofuranose moiety, is a weak substrate. Kinetic characterization of the enzyme using four of the oligosaccharide acceptors gave K(m) values ranging from 204 microM to 1.7 mM. Through the use of NMR spectroscopy and mass spectrometry, we demonstrated that this recombinant enzyme, like the wild-type protein, is bifunctional and can synthesize both beta-(1-->6) and beta-(1-->5)-linkages in an alternating fashion. Access to purified glfT is expected to facilitate the development of high-throughput assays for the identification of inhibitors of the enzyme, which are potential antituberculosis agents.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,628

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,195
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle