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Enregistrement W2050202349 · doi:10.1007/s12079-012-0174-2

Flaws in the peer-reviewing process : a critical look at a recent paper studying the role of CCN3 in renal cell carcinoma

2012· article· en· W2050202349 sur OpenAlexfundno aff
Bernard Perbal

Notice bibliographique

RevueJournal of Cell Communication and Signaling · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnective Tissue Growth Factor Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesSchulich School of Medicine and DentistryHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Mots-clésProcess (computing)Computer scienceRenal cell carcinomaField (mathematics)Critical path methodData scienceExperimental dataComputational biologyEngineering ethicsMedical physicsMedicineBiologyPathologyMathematicsStatistics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A critical look at a recently published manuscript reporting the role of CCN3 in the regulation of clear cell renal cell carcinoma (RCC) biology raises several scientific concerns, and reveals flaws in the reviewing process which appear to have resulted in the dissemination of conclusions that are not supported by proper experimental procedures. In the example presented here, the observed biological effects are attributed to a high molecular weight "CCN3" protein which is detected by a single commercial antibody that was not shown in the experimental conditions used by the authors to be a valid reagent capable of stringently detecting the "canonical" CCN3 protein. Experiments establishing that inhibiting the production of high molecular weight "CCN3" protein would reverse these biological effects were not performed. The case discussed here clearly demonstrates that unreliable data can go through peer reviewing and be published. As the data can end up being cited and used as a potential reference by new investigators in the field, we believe that such data can throw roadblocks across the scientific path of inquiry and mislead investigations. We therefore raise awareness for the need of a more stringent peer reviewing process in which assurance can be had that the strength and precision of the data have been thoroughly checked by experts in the CCN field, and previous work properly referenced.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,174
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,477
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Évaluation · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,978
Score d'incertitude au seuil0,920

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1740,477
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,004
Bibliométrie0,0070,005
Études des sciences et des technologies0,0100,021
Communication savante0,0170,011
Science ouverte0,0070,004
Intégrité de la recherche0,0220,028
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,329
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
DomaineÉvaluation
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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