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Enregistrement W2050239959 · doi:10.1074/jbc.m109.058552

Dynamic Changes in the Subcellular Distribution of Gpd1p in Response to Cell Stress

2009· article· en· W2050239959 sur OpenAlexafffund
Sunhee Jung, Marcello Marelli, Richard A. Rachubinski, David R. Goodlett, John D. Aitchison

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePeroxisome Proliferator-Activated Receptors
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of General Medical SciencesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésPeroxisomeCell biologyCytosolCellular compartmentPeroxisomal targeting signalSubcellular localizationBiochemistryBiologyMitochondrionOsmotic shockCellCytoplasmEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gpd1p is a cytosolic NAD(+)-dependent glycerol 3-phosphate dehydrogenase that also localizes to peroxisomes and plays an essential role in the cellular response to osmotic stress and a role in redox balance. Here, we show that Gpd1p is directed to peroxisomes by virtue of an N-terminal type 2 peroxisomal targeting signal (PTS2) in a Pex7p-dependent manner. Significantly, localization of Gpd1p to peroxisomes is dependent on the metabolic status of cells and the phosphorylation of aminoacyl residues adjacent to the targeting signal. Exposure of cells to osmotic stress induces changes in the subcellular distribution of Gpd1p to the cytosol and nucleus. This behavior is similar to Pnc1p, which is coordinately expressed with Gpd1p, and under conditions of cell stress changes its subcellular distribution from peroxisomes to the nucleus where it mediates chromatin silencing. Although peroxisomes are necessary for the beta-oxidation of fatty acids in yeast, the localization of Gpd1p to peroxisomes is not. Rather, shifts in the distribution of Gpd1p to different cellular compartments in response to changing cellular status suggests a role for Gpd1p in the spatial regulation of redox potential, a process critical to cell survival, especially under the complex stress conditions expected to occur in the wild.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,340

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations86
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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