Cdx1 and Cdx2 Exhibit Transcriptional Specificity in the Intestine
Notice bibliographique
Résumé
The caudal-related homeodomain transcription factors Cdx1 and Cdx2 are expressed in the developing endoderm with expression persisting into adulthood. Cdx1(-/-) mutants are viable and fertile and display no overt intestinal phenotype. Cdx2 null mutants are peri-implantation lethal; however, conditional mutation approaches have revealed that Cdx2 is required for patterning the intestinal epithelium and specification of the colon. Cdx2 is also necessary for homeostasis of the intestinal tract in the adult, where Cdx1 and Cdx2 appear to functionally overlap in the distal colon, but not during intestinal development. Cdx1 and Cdx2 exhibit complete overlap of expression in the intestine, although they differ in their relative levels, with Cdx1 maximal in the distal colon and Cdx2 peaking in the proximal cecum. Moreover, Cdx1 protein is graded along the crypt-villus axis, being abundant in the crypts and diminishing towards the villi. Cdx2 is expressed uniformly along this axis, but is differentially phosphorylated; the functional relevance of these expression domains and phosphorylation is currently unknown. Cdx1 and Cdx2 have been suggested to exhibit functional specificity in the intestinal tract. In the present study, using cell-based models, we found that relative to Cdx1, Cdx2 was significantly less potent at effecting a transcriptional response from the Cdx1 promoter, a known Cdx target gene. We subsequently assessed this relationship in vivo using a "gene swap" approach and found that Cdx2 cannot substitute for Cdx1 in this autoregulatory loop. This is in marked contrast with the ability of Cdx2 to support Cdx1 expression and function in paraxial mesoderm and vertebral patterning, thus providing novel in vivo evidence of context-dependent transcriptional specificity between these transcription factors.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».