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Enregistrement W2050351928 · doi:10.1111/tpj.12330

Virus‐induced gene silencing identifies <i><scp>C</scp>atharanthus roseus</i> 7‐deoxyloganic acid‐7‐hydroxylase, a step in iridoid and monoterpene indole alkaloid biosynthesis

2013· article· en· W2050351928 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueThe Plant Journal · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePhytochemistry and Biological Activities
Établissements canadiensBrock University
Organismes subventionnairesOntario Ministry of Research and InnovationMcGill UniversityGenome PrairieGenome AlbertaGenome British ColumbiaGenome Canada
Mots-clésIridoidBiologyBiosynthesisBiochemistryHydroxylationGene silencingCatharanthus roseusGeneEnzymeBotanyGlycoside

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Iridoids are a major group of biologically active molecules that are present in thousands of plant species, and one versatile iridoid, secologanin, is a precursor for the assembly of thousands of monoterpenoid indole alkaloids (MIAs) as well as a number of quinoline alkaloids. This study uses bioinformatics to screen large databases of annotated transcripts from various MIA-producing plant species to select candidate genes that may be involved in iridoid biosynthesis. Virus-induced gene silencing of the selected genes combined with metabolite analyses of silenced plants was then used to identify the 7-deoxyloganic acid 7-hydroxylase (CrDL7H) that is involved in the 3rd to last step in secologanin biosynthesis. Silencing of CrDL7H reduced secologanin levels by at least 70%, and increased the levels of 7-deoxyloganic acid to over 4 mg g(-1) fresh leaf weight compared to control plants in which this iridoid is not detected. Functional expression of this CrDL7H in yeast confirmed its biochemical activity, and substrate specificity studies showed its preference for 7-deoxyloganic acid over other closely related substrates. Together, these results suggest that hydroxylation precedes carboxy-O-methylation in the secologanin pathway in Catharanthus roseus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,041
Score d'incertitude au seuil0,399

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,191
Écart entre enseignants0,171 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle