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Enregistrement W2050408194 · doi:10.3109/13813455.2013.812122

2-dimensional gel electrophoresis reloaded

2013· editorial· en· W2050408194 sur OpenAlexaff
Stefan Lehr, Reiner Westermeier

Notice bibliographique

RevueArchives of Physiology and Biochemistry · 2013
Typeeditorial
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueAdvanced Proteomics Techniques and Applications
Établissements canadiensAdvanced Electrophoresis Solutions (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryElectrophoresisChromatography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Today the omnipresence of MS-based proteomic approaches suggest, that 2-dimensional gel (2-DE) based proteomics is dead. In reality, this is far from the truth, and also after three decades high-resolution 2-DE, introduced by Patrick O’Farrell in 1975, still represents a key technology to investigate thousands of protein species, their isoforms and modifications simultaneously. Especially, in combination with multi fluorescence labelling and various MS-methodologies, it is very popular to relatively quantify and identify proteins in complex mixtures. But also after these 30 years of use, reproducibility and process stability are still under constant improvement to further enhance robustness and feasibility of the method. In order to offer an opportunity to discuss and apply the latest developments in 2-DE in a scientific context we picked out this technology as central theme for the International Protein Rainbow Workshop titled ‘‘2-Dimensional Gel Electrophoresis Reloaded’’, which was held at the Institute of Clinical Biochemistry and Pathobiochemistry at the German Diabetes-Center in Duesseldorf. This annual hands-on training course, comprising theoretical and practical aspects of the technology, was accompanied by a lecture day giving an overview of recent 2-DE applications in scientific research. In dependence on this the current issue ‘‘2-Dimensional Gel Electrophoresis Reloaded’’ should help to give an overview of recent developments and applications related to 2-DE. The collection of scientific reports covers a broad range of applications, starting with an inter-laboratory comparison introducing a simplified and robust 2-DE work-flow. In addition a novel fluorescent dye for improved protein detection is described and pre-analytical conditions for serum proteomics, representing one crucial point for biomarker discovery are addressed. Another study examines differences and similarities between protein patterns derived from mitochondria and peroxisomes or describe the characterization of sub-types in small cell lung cancer (SCLC).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,720
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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