Catalytic Mechanism of Fungal Homoserine Transacetylase
Notice bibliographique
Résumé
Homoserine transacetylase is a required catalyst in the biochemical pathway that metabolizes Asp to Met in fungi. The enzyme from the yeast Schizosaccharomyces pombe activates the hydroxyl group of L-homoserine by acetylation from acetyl coenzyme A. This enzyme is unique to fungi and some bacteria and presents an important new target for drug discovery. Steady-state kinetic parameters provide evidence that this enzyme follows a ping-pong mechanism. Proton inventory was consistent with a single-proton transfer, and pH studies suggested the participation of at least one residue with a pKa value of 6.4-6.6, possibly a His or Asp/Glu in catalysis. Protein sequence alignments indicate that this enzyme belongs to the alpha/beta-hydrolase fold superfamily of enzymes, indicating the involvement of an active-site nucleophile and possibly a canonical catalytic triad. We constructed site-specific mutants and identified Ser163, Asp403, and His432 as the likely active-site residues of a catalytic triad based on steady-state kinetics and genetic complementation of a yeast null mutant. Moreover, unlike the wild-type enzyme, inactive site mutants were not capable of producing an acetyl-enzyme intermediate. Homoserine transacetylase therefore catalyzes the acetylation of L-homoserine via a covalent acyl-enzyme intermediate through an active-site Ser. These results form the basis of future exploitation of this enzyme as an antimicrobial target.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».