Nucleosome Assembly Proteins Bind to Epstein-Barr Virus Nuclear Antigen 1 and Affect Its Functions in DNA Replication and Transcriptional Activation
Notice bibliographique
Résumé
The EBNA1 protein of Epstein-Barr virus (EBV) plays several important roles in EBV latent infection, including activating DNA replication from the latent origin of replication (oriP) and activating the transcription of other latency genes within the EBV chromatin. These functions require EBNA1 binding to the DS and FR elements within oriP, respectively, although how these interactions activate these processes is not clear. We previously identified interactions of EBNA1 with the related nucleosome assembly proteins NAP1 and TAF-I, known to affect the replication and transcription of other chromatinized templates. We have further investigated these interactions, showing that EBNA1 binds directly to NAP1 and to the beta isoform of TAF-I (also called SET) and that these interactions greatly increase the solubility of EBNA1 in vitro. These interactions were confirmed in EBV-infected cells, and chromatin immunoprecipitation with these cells showed that NAP1 and TAF-I both localized with EBNA1 to the FR element, while only TAF-I was detected with EBNA1 at the DS element. In keeping with these observations, alteration of the NAP1 or TAF-Ibeta level by RNA interference and overexpression inhibited transcriptional activation by EBNA1 in FR reporter assays. In addition, EBNA1-mediated DNA replication was stimulated when TAF-I (but not NAP1) was downregulated and was inhibited by TAF-Ibeta overexpression. The results indicate that the interaction of EBNA1 with NAP1 and TAF-I is important for transcriptional activation and that EBNA1 recruits TAF-I to the DS element, where it negatively regulates DNA replication.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».