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Enregistrement W2050487006 · doi:10.1002/jcb.22339

Physiological and coordinate downregulation of the NPC1 and NPC2 genes are associated with the sequestration of LDL‐derived cholesterol within endocytic compartments

2009· article· en· W2050487006 sur OpenAlexafffund
David Jelínek, Sarah Mount Patrick, Khameeka N. Kitt, Teddy Chan, Gordon A. Francis, William S. Garver

Notice bibliographique

RevueJournal of Cellular Biochemistry · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLysosomal Storage Disorders Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésNPC1Endocytic cycleEndosomeSterol regulatory element-binding proteinDownregulation and upregulationCell biologySterolCholesterolChemistryEndoplasmic reticulumBiochemistrySterol O-acyltransferaseLipid dropletEndocytosisLipoproteinBiologyIntracellularGeneCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Niemann-Pick C1 and C2 (NPC1 and NPC2) proteins have a central role in regulating the transport of lipoprotein-derived cholesterol from endocytic compartments to the endoplasmic reticulum for esterification by acyl-CoA:cholesterol acyltransferase (ACAT) and feedback inhibition of the sterol regulatory element-binding protein (SREBP) pathway. Since the NPC1 gene/protein has recently been shown to be downregulated by feedback inhibition of the SREBP pathway, the present study was performed to determine whether physiological downregulation of the NPC1 gene/protein alters the transport and metabolism of low-density lipoprotein (LDL)-derived cholesterol in human fibroblasts. To perform this study, three different culture conditions were used that included fibroblasts grown in lipoprotein-deficient serum (LPDS), LPDS supplemented with LDL, and LPDS supplemented with LDL, followed by equilibration in the absence of LDL to allow the transport of LDL-derived cholesterol from endocytic compartments and equilibration of cellular sterol pools. The results from this study indicated that in addition to the NPC1 gene/protein, the NPC2 gene/protein was also downregulated by LDL-derived cholesterol-dependent feedback inhibition and that downregulation of both the NPC1 and NPC2 genes/proteins was associated with the sequestration of LDL-derived cholesterol within endocytic compartments, including late endosomes/lysosomes after equilibration. Therefore, it is proposed that physiological and coordinate downregulation of the NPC1 and NPC2 genes/proteins promotes the sequestration of LDL-derived cholesterol within endocytic compartments and serves a role in maintaining intracellular cholesterol homeostasis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,307
Score d'incertitude au seuil0,193

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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