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Enregistrement W2050683786 · doi:10.1093/nar/gkl375

A modified version of a Fos-associated cluster in HBZ affects Jun transcriptional potency

2006· article· en· W2050683786 sur OpenAlexafffund
Patrick Hivin, Charlotte Arpin-André, Isabelle Clerc, Benoı̂t Barbeau, Jean-Michel Mesnard

Notice bibliographique

RevueNucleic Acids Research · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueT-cell and Retrovirus Studies
Établissements canadiensUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesGroupement des Entreprises Françaises dans la lutte contre le CancerLigue Contre le CancerCentre National de la Recherche ScientifiqueCancer Research SocietyAssociation pour la Recherche sur le Cancer
Mots-clésBiologyc-junMutantTranscriptional regulationDNAGeneTranscriptional activityTranscription factorTranscription (linguistics)Reporter geneCell biologyMolecular biologyGene expressionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Like c-Fos, HBZ (HTLV-I bZIP factor) is able to interact with c-Jun but differs considerably from c-Fos in its ability to activate AP-1-responsive genes since HBZ rather inhibits transcriptional activity of c-Jun. To better understand the molecular mechanisms involved in this down-regulation of c-Jun activity, a large number of HBZ/c-Fos chimeras was constructed and analyzed for their ability to interact with c-Jun, to bind to the AP-1 motif and to stimulate expression of a reporter gene containing the collagenase promoter. By this approach, we demonstrate that the DNA-binding domain of HBZ is responsible for its inhibitory effect on the trans-activation potential of c-Jun. However, unexpectedly, we found that exchange of a cluster of six charged amino acids immediately adjacent to the DNA contact region altered significantly transcriptional activity of chimeras. This particular subdomain could be involved in efficient presentation of the AP-1 complex to the transcriptional machinery. To confirm this role, specific residues present in the cluster of HBZ were substituted for corresponding amino acids in c-Fos. Unlike the JunD-activating potential of wild-type HBZ, this mutant was no longer able to stimulate JunD activity, confirming the key role of this particular cluster in regulation of Jun transcriptional potency.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,871
Score d'incertitude au seuil0,394

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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