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Enregistrement W2050746386 · doi:10.1186/1746-6148-8-38

Prevalence and molecular characterization of Clostridium difficileisolated from feedlot beef cattle upon arrival and mid-feeding period

2012· article· en· W2050746386 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueBMC Veterinary Research · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClostridium difficile and Clostridium perfringens research
Établissements canadiensAlberta Health ServicesPublic Health Agency of CanadaUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesAlberta Beef ProducersPublic Health AgencyPublic Health Agency of Canada
Mots-clésClostridium difficilePulsed-field gel electrophoresisRibotypingBiologyMicrobiologyFecesVeterinary medicineBeef cattleFeedlotClostridiumClostridiaceaeAnimal scienceAntibioticsMedicineGenotypeBacteriaToxinGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The presence of indistinguishable strains of Clostridium difficile in humans, food animals and food, as well as the apparent emergence of the food-animal-associated ribotype 078/toxinotype V as a cause of community-associated C. difficile infection have created concerns about the potential for foodborne infection. While studies have reported C. difficile in calves, studies of cattle closer to the age of harvest are required. Four commercial feedlots in Alberta (Canada) were enrolled for this study. Fecal samples were collected at the time of arrival and after acclimation (< 62, 62-71 or > 71 days on feed). Selective culture for Clostridium difficile was performed, and isolates were characterized by ribotyping and pulsed-field gel electrophoresis. A logistic regression model was built to investigate the effect of exposure to antimicrobial drugs on the presence of C. difficile. RESULTS: Clostridium difficile was isolated from 18 of 539 animals at the time of feedlot arrival (CI = 2.3-6.1) and from 18 of 335 cattle at mid-feeding period (CI = 2.9-13.1). Overall, there was no significant difference in the prevalence of C. difficile shedding on arrival versus mid-feeding period (P = 0.47). No association between shedding of the bacterium and antimicrobial administration was found (P = 0.33). All the isolates recovered were ribotype 078, a toxinotype V strain with genes encoding toxins A, B and CDT. In addition, all strains were classified as NAP7 by pulsed field gel electrophoresis (PFGE) and had the characteristic 39 base pairs deletion and upstream truncating mutation on the tcdC gene. CONCLUSIONS: It is apparent that C. difficile is carried in the intestinal tracts of a small percentage of feedlot cattle arriving and later in the feeding period and that ribotype 078/NAP7 is the dominant strain in these animals. Herd management practices associated with C. difficile shedding were not identified, however further studies of the potential role of antimicrobials on C. difficile acquisition and shedding are required.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,378
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,085
Tête enseignante GPT0,355
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle