Calcium-Dependent Complex Formation Between PBP2 and Lytic Transglycosylase SltB1 of <i>Pseudomonas aeruginosa</i>
Notice bibliographique
Résumé
In Gram-negative bacteria, the bacterial cell wall biosynthetic mechanism requires the coordinated action of enzymes and structural proteins located in the cytoplasm, within the membrane, and in the periplasm of the cell. Its main component, peptidoglycan (PG), is essential for cell division and wall elongation. Penicillin-binding proteins (PBPs) catalyze the last steps of PG biosynthesis, namely the polymerization of glycan chains and the cross-linking of stem peptides, and can be either monofunctional or bifunctional. Their action is coordinated with that of other enzymes essential for cell-wall biosynthesis, such as lytic transglycosylases (LT). Here, we have studied SltB1, an LT from Pseudomonas aeruginosa, and identified that it forms a complex with PBP2, a monofunctional enzyme, which requires the presence of Ca(2+). In addition, we have solved the structure of SltB1 to a high resolution, and identified that it harbors an EF-hand like motif containing a Ca(2+) ion displaying bipyramidal coordination. These studies provide initial structural details that shed light on the interactions between the PG biosynthesis enzymes in P. aeruginosa.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».