The effect of the <i>MHC</i> locus on autoantibodies in type 1 diabetes
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: To investigate whether the presence of autoantibodies specific for type 1 diabetes (T1D) is determined by the major genetic susceptibility locus for the disease at the HLA genes, using the T1D Genetics Consortium data. METHODS: We analysed anti-IA-2 and anti-GAD 65 autoantibody data from 2282 T1D patients from 1117 multiplex families. HLA genotyping was available for all cases and their parents and association with autoantibody positivity was tested by the transmission disequilibrium test. RESULTS: Association of anti-IA-2 with the HLA genes was detected at high statistical significance. HLA-DRB1*0401 confers both the strongest type 1 diabetes risk, and positive association of anti-IA-2, whereas the DRB1*03- DQA1*0501-DQB1*0201 haplotype, associated less strongly with T1D, showed a significant negative association with anti-IA-2 positivity. Interestingly, HLA-A*24 is also negatively associated with anti-IA-2, independently of the DRB1*03- DQA1*0501-DQB1*0201 haplotype. No statistically significant association was identified between anti-GAD65 and HLA. CONCLUSIONS: This study highlights that IA-2 as an autoantigen depends on HLA genotype and suggests new insights into the mechanism of loss of immune tolerance.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».