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Enregistrement W2050845585 · doi:10.1021/bi001837+

Purification and Biophysical Characterization of a Minimal Functional Domain and of an N-Terminal Zn<sup>2+</sup>-Binding Fragment from the Human Papillomavirus Type 16 E6 Protein

2001· article· en· W2050845585 sur OpenAlexaff
Francesco Lipari, Graham A. McGibbon, Elizabeth Wardrop, Michael G. Cordingley

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCervical Cancer and HPV Research
Établissements canadiensBoehringer Ingelheim (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryCysteineSize-exclusion chromatographyMonomerCircular dichroismAmino acidLysisSedimentation equilibriumStereochemistryBiochemistryUltracentrifugeEnzymePolymer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The E6 Zn(2+)-binding protein of high-risk human papillomaviruses (HPVs) is one of the major transforming proteins encoded by these tumor viruses. A bacterial system was used to express wild type and truncated forms of HPV-16 E6 linked to GST. The recombinant proteins were released from GST through cleavage of a factor Xa site. Functional analysis of these proteins demonstrated that amino acids 2--142 comprise the minimal domain of E6 required to promote the degradation of p53 in vitro in a rabbit reticulocyte lysate. This purified protein, E6(Delta 143--151), required a high salt concentration for maximum solubility, eluted as a monomer on gel filtration, and was shown to bind two Zn(2+) ions by atomic absorption analysis. An N-terminal subdomain of E6 (amino acids 2--77, E6-N) was similarly purified. Unlike E6(Delta 143--151), E6--N was very soluble in low-salt buffers and hence was highly amenable to biophysical characterization. E6-N was shown to bind one Zn(2+) ion by electrospray mass spectrometry and by atomic absorption analysis. UV--visible spectroscopic analysis of Co(2+)-substituted E6--N revealed that four cysteine residues coordinate the metal ion. Mutational studies of all the cysteine residues in E6--N substantiated a critical role for Cys 30, 33, 63, and 66 in Zn(2+) binding and in proper folding of the subdomain. Equilibrium sedimentation of E6-N demonstrated that it is a monomer, like E6(Delta 143--151), at low concentrations, but dimerization occurs at high concentrations (K(d) = 0.1 mM). Finally, circular dichroism studies revealed significant secondary structure for both E6(Delta 143--151) and E6--N. The results support a model of monomeric E6 possessing two functionally critical Zn(2+)-binding motifs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,290
Score d'incertitude au seuil0,418

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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