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Enregistrement W2050879934 · doi:10.1002/mgg3.91

Exome analysis identifies <scp>B</scp>rody myopathy in a family diagnosed with malignant hyperthermia susceptibility

2014· article· en· W2050879934 sur OpenAlexafffund
Nyamkhishig Sambuughin, Elena Zvaritch, Natasha Kraeva, Olga Sizova, Erica L. Sivak, Kelley M Dickson, Margaret R. Weglinski, John F. Capacchione, Sheila M. Muldoon, Sheila Riazi, Susan L. Hamilton, Barbara W. Brandom, David H. MacLennan

Notice bibliographique

RevueMolecular Genetics & Genomic Medicine · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensToronto General HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchUniformed Services University of the Health SciencesNational Institutes of Health
Mots-clésMalignant hyperthermiaMyopathyExome sequencingMedicineExomeRYR1Internal medicineMutationEndocrinologyGeneticsBiologyPathologyCalciumRyanodine receptorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Whole exome sequencing (WES) was used to determine the primary cause of muscle disorder in a family diagnosed with a mild, undetermined myopathy and malignant hyperthermia (MH) susceptibility (MHS). WES revealed the compound heterozygous mutations, p.Ile235Asn and p.Glu982Lys, in ATP2A1, encoding the sarco(endo)plasmic reticulum Ca(2+) ATPase type 1 (SERCA1), a calcium pump, expressed in fast-twitch muscles. Recessive mutations in ATP2A1 are known to cause Brody myopathy, a rare muscle disorder characterized by exercise-induced impairment of muscle relaxation and stiffness. Analyses of affected muscles showed the absence of SERCA1, but SERCA2 upregulation in slow and fast myofibers, suggesting a compensatory mechanism that partially restores the diminished Ca(2+) transport in Brody myopathy. This compensatory adaptation to the lack of SERCA1 Ca(2+) pumping activity within the muscle explains, in part, the mild course of disease in our patient. Diagnosis of MHS in this family was secondary to a loss of SERCA1 due to disease-associated mutations. Although there are obvious differences in clinical expression and molecular mechanisms between MH and Brody myopathy, a feature common to both conditions is elevated myoplasmic Ca(2+) content. Prolonged intracellular Ca(2+) elevation is likely to have led to MHS diagnosis in vitro and postoperative MH-like symptoms in Brody patient.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,786
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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