Central Region of the Human Splicing Factor Hprp3p Interacts with Hprp4p
Notice bibliographique
Résumé
Human splicing factors Hprp3p and Hprp4p are associated with the U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein particle, which is essential for the assembly of an active spliceosome. Currently, little is known about the specific roles of these factors in splicing. In this study, we characterized the molecular interaction between Hprp3p and Hprp4p. Constructs were created for expression of Hprp3p or its mutants in bacterial or mammalian cells. We showed that antibodies against either Hprp3p or Hprp4p were able to pull-down the Hprp3p-Hprp4p complex formed in Escherichia coli lysates. By co-immunoprecipitation and isothermal titration calorimetry, we demonstrated that purified Hprp3p and its mutants containing the central region, but lacking either the N-terminal 194 amino acids or the C-terminal 240 amino acids, were able to interact with Hprp4p. Conversely, Hprp3p mutants containing only the N- or C-terminal region did not interact with Hprp4p. In addition, by co-immunoprecipitation, we showed that intact Hprp3p and its mutants containing the central region interacted with Hprp4p in HeLa cell nuclear extracts. Primer extension analysis illustrated that the central region of Hprp3p is required to maintain the association of Hprp3p-Hprp4p with U4/U6 small nuclear RNAs, suggesting that this Hprp3p/Hprp4p interaction allows the recruitment of Hprp4p, and perhaps other protein(s), to the U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein particle.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».