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Enregistrement W2051156063 · doi:10.1159/000334050

Low Levels of X-Inactive Specific Transcript in Somatic Cell Nuclear Transfer Embryos Derived from Female Bovine Freemartin Donor Cells

2011· article· en· W2051156063 sur OpenAlexafffund
Byeong-Gyun Jeon, Gyu‐Jin Rho, Dean H. Betts, Jim Petrik, Laura A. Favetta, W.A. King

Notice bibliographique

RevueSexual Development · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchOntario Ministry of Food and Agriculture
Mots-clésSomatic cell nuclear transferBiologyEmbryoBlastocystAndrologyXISTMolecular biologyEmbryogenesisGeneticsGeneX-inactivationX chromosome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The present study compared developmental potential, telomerase activity and transcript levels of X-linked genes (HPRT, MECP2, RPS4X, SLC25A6, XIAP, XIST and ZFX) in bovine somatic cell nuclear transfer (SCNT) embryos reconstructed with cells derived from a freemartin (female with a male co-twin) or from normal female cattle (control). The rates of cleavage, development to blastocyst and hatched blastocyst stage, and the mean numbers of total and inner cell mass cells in the freemartin SCNT embryos were not significantly different from those of control SCNT embryos (p > 0.05). The levels of telomerase activity analyzed by RQ-TRAP in the freemartin SCNT embryos were also similar to those of the normal SCNT embryos. Transcript levels of HPRT, MECP2, RPS4X and XIAP, measured by quantitative real-time RT-PCR, were not significantly different between the control and freemartin SCNT embryos (p > 0.05). However, the transcript levels of SLC25A6, XIST and ZFX were significantly decreased in the freemartin SCNT embryos compared to control SCNT embryos (p < 0.05). Transfer of 71 freemartin SCNT embryos to 22 recipient cows resulted in 4 (18%) pregnancies, which were lost between days 28 and 90 of gestation. Taken together, the present study demonstrates that the transcript levels of several X-linked genes, especially XIST, showed an aberrant pattern in the freemartin SCNT embryos, suggesting aberrant X inactivation in freemartin clones which may affect embryo survival.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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