The HECT Domain Ligase Itch Ubiquitinates Endophilin and Localizes to the trans-Golgi Network and Endosomal System
Notice bibliographique
Résumé
Endophilin A1 is an SH3 domain-containing protein functioning in membrane trafficking on the endocytic pathway. We have identified the E3 ubiquitin ligase itch/AIP4 as an endophilin A1-binding partner. Itch belongs to the Nedd4/Rsp5p family of proteins and contains an N-terminal C2 domain, four WW domains and a catalytic HECT domain. Unlike other Nedd4/Rsp5p family members, itch possesses a short proline-rich domain that mediates its binding to the SH3 domain of endophilin A1. Itch ubiquitinates endophilin A1 and the SH3/proline-rich domain interaction facilitates this activity. Interestingly, itch co-localizes with markers of the endosomal system in a C2 domain-dependent manner and upon EGF stimulation, endophilin A1 translocates to an EGF-positive endosomal compartment where it colocalizes with itch. Moreover, EGF treatment of cells stimulates endophilin A1 ubiquitination. We have thus identified endophilin A1 as a substrate for the endosome-localized ubiquitin ligase itch. This interaction may be involved in ubiquitin-mediated sorting mechanisms operating at the level of endosomes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».