Evaluation of PetrifilmsTM as a diagnostic test to detect bovine mastitis organisms in Kenya
Notice bibliographique
Résumé
The study purpose was to validate Petrifilms(TM) (3M Microbiology, 2005) against standard culture methods in the diagnosis of bovine mastitis organisms in Kenya. On 128 smallholder dairy cattle farms in Kenya, between June 21, 2010 and August 31, 2010, milk samples from 269 cows that were positive on California Mastitis Test (CMT) were cultured using standard laboratory culture methods and Petrifilms(TM) (Aerobic Count and Coliform Count -3M Microbiology, 2005), and results were compared. Staphylococcus aureus was the most common bacterium isolated (73 % of samples). Clinical mastitis was found in only three cows, and there were only two Gram-negative isolates, making it impossible to examine the agreement between the two tests for Gram-negative- or clinical mastitis samples. The observed agreement between the standard culture and Petrifilm(TM) (3M Microbiology, 2005) results for Gram-positive isolates was 85 %, and there was fair agreement beyond that expected due to chance alone, with a kappa (κ) of 0.38. Using culture results as a gold standard, the Petrifilms(TM) had a sensitivity of 90 % for Gram-positive samples and specificity of 51 %. With 87 % of CMT-positive samples resulting in Gram-positive pathogens cultured, there was a positive predictive value of 93 % and a negative predictive value of 43 %. Petrifilms(TM) should be considered for culture of mastitis organisms in developing countries, especially when Gram-positive bacteria are expected.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,008 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».