Structural determination of the phosphorylation domain of the ryanodine receptor
Notice bibliographique
Résumé
The ryanodine receptor ( R y R ) is a large, homotetrameric sarcoplasmic reticulum membrane protein that is essential for C a 2+ cycling in both skeletal and cardiac muscle. Genetic mutations in R y R 1 are associated with severe conditions including malignant hyperthermia ( MH ) and central core disease. One phosphorylation site ( S er 2843) has been identified in a segment of R y R 1 flanked by two R y R motifs, which are found exclusively in all R y R isoforms as closely associated tandem (or paired) motifs, and are named after the protein itself. These motifs also contain six known MH mutations. In this study, we designed, expressed and purified the tandem R y R motifs, and show that this domain contains a putative binding site for the C a 2+ /calmodulin‐dependent protein kinase β isoform. We present a 2.2 Å resolution crystal structure of the R y R domain revealing a two‐fold, symmetric, extended four‐helix bundle stabilized by a β sheet. Using mathematical modelling, we fit our crystal structure within a tetrameric electron microscopy (EM) structure of native R y R 1, and propose that this domain is localized in the R y R clamp region, which is absent in its cousin protein inositol 1,4,5‐trisphosphate receptor. Database The crystal structure of the RyR1 phosphorylation domain (amino acid residues 2734–2940) has been submitted to the Protein Data Bank under accession number 3RQR . Structured digital abstract RyR1 C3 physically interacts with CaMKIIβ by pull down ( View interaction ) RyR1 C3 binds to CaMKIIβ by pull down ( View interaction ) CaMKIIβ physically interacts with RyR1 C3 by anti tag coimmunoprecipitation (View Interaction: 1 , 2 )
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».