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Enregistrement W2051432574 · doi:10.1371/journal.pgen.1000296

Disruption of AP1S1, Causing a Novel Neurocutaneous Syndrome, Perturbs Development of the Skin and Spinal Cord

2008· article· en· W2051432574 sur OpenAlexafffund
Alexandre Montpetit, Stéphanie Côté, Edna Brustein, Christian A. Drouin, Line Lapointe, Michèle Boudreau, Caroline Meloche, Régen Drouin, Thomas J. Hudson, Pierre Drapeau, Patrick Cossette

Notice bibliographique

RevuePLoS Genetics · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA regulation and disease
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer ResearchMcGill University and Génome Québec Innovation CentreCégep de Rivière-du-LoupUniversité de SherbrookeHôpital Notre-DameUniversité de MontréalMcGill University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchGenome Canada
Mots-clésBiologySpinal cordNeuroscienceBioinformaticsGeneticsComputational biologyCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Adaptor protein (AP) complexes regulate clathrin-coated vesicle assembly, protein cargo sorting, and vesicular trafficking between organelles in eukaryotic cells. Because disruption of the various subunits of the AP complexes is embryonic lethal in the majority of cases, characterization of their function in vivo is still lacking. Here, we describe the first mutation in the human AP1S1 gene, encoding the small subunit sigma1A of the AP-1 complex. This founder splice mutation, which leads to a premature stop codon, was found in four families with a unique syndrome characterized by mental retardation, enteropathy, deafness, peripheral neuropathy, ichthyosis, and keratodermia (MEDNIK). To validate the pathogenic effect of the mutation, we knocked down Ap1s1 expression in zebrafish using selective antisens morpholino oligonucleotides (AMO). The knockdown phenotype consisted of perturbation in skin formation, reduced pigmentation, and severe motility deficits due to impaired neural network development. Both neural and skin defects were rescued by co-injection of AMO with wild-type (WT) human AP1S1 mRNA, but not by co-injecting the truncated form of AP1S1, consistent with a loss-of-function effect of this mutation. Together, these results confirm AP1S1 as the gene responsible for MEDNIK syndrome and demonstrate a critical role of AP1S1 in development of the skin and spinal cord.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations172
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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