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Enregistrement W2051556275 · doi:10.1073/pnas.1202369109

Rescue of Notch signaling in cells incapable of GDP- <scp>l</scp> -fucose synthesis by gap junction transfer of GDP- <scp>l</scp> -fucose in <i>Drosophila</i>

2012· article· en· W2051556275 sur OpenAlexfundno aff
Tomonori Ayukawa, Kenjiroo Matsumoto, Hiroyuki Ishikawa, Akira Ishio, Tomoko Yamakawa, Naoki Aoyama, Takuya Suzuki, Kenji Matsuno

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueInvertebrate Immune Response Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesPrecursory Research for Embryonic Science and TechnologyJapan Science and Technology CorporationInstitute of GeneticsNaito Foundation
Mots-clésFucoseFucosylationBiochemistryCell biologyBiologyNotch signaling pathwayIntracellularGlycanChemistrySignal transductionGlycoprotein

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Notch (N) is a transmembrane receptor that mediates cell-cell interactions to determine many cell-fate decisions. N contains EGF-like repeats, many of which have an O-fucose glycan modification that regulates N-ligand binding. This modification requires GDP-L-fucose as a donor of fucose. The GDP-L-fucose biosynthetic pathways are well understood, including the de novo pathway, which depends on GDP-mannose 4,6 dehydratase (Gmd) and GDP-4-keto-6-deoxy-D-mannose 3,5-epimerase/4-reductase (Gmer). However, the potential for intercellularly supplied GDP-L-fucose and the molecular basis of such transportation have not been explored in depth. To address these points, we studied the genetic effects of mutating Gmd and Gmer on fucose modifications in Drosophila. We found that these mutants functioned cell-nonautonomously, and that GDP-L-fucose was supplied intercellularly through gap junctions composed of Innexin-2. GDP-L-fucose was not supplied through body fluids from different isolated organs, indicating that the intercellular distribution of GDP-L-fucose is restricted within a given organ. Moreover, the gap junction-mediated supply of GDP-L-fucose was sufficient to support the fucosylation of N-glycans and the O-fucosylation of the N EGF-like repeats. Our results indicate that intercellular delivery is a metabolic pathway for nucleotide sugars in live animals under certain circumstances.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,839

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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