The characteristics of VIM-1-producing<i>Klebsiella pneumoniae</i>from South Africa
Notice bibliographique
Résumé
A study was designed to characterize a carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae (KPSA01) isolated from a patient in Gauteng, South Africa without recent travel outside South Africa. Molecular characterization was done using isoelectric focusing, polymerase chain reaction and sequencing for bla(VIM), bla(IMP), bla(NDM), bla(CTX-Ms), bla(OXAs), bla(TEMs), and bla(SHV), plasmid-mediated quinolone resistance determinants, multilocus sequencing typing, plasmid replicon typing, and addiction factors. KPSA01 produced VIM-1 and belonged to the newly described sequence type ST569. The plasmid that harboured bla(VIM) typed within the narrow host range IncF replicon group, contained the aadA1 gene cassette, and tested positive for the vagCD and ccdAB addiction systems. This is the first report of VIM-1-producing K. pneumoniae outside Europe. It is important that surveillance studies be undertaken in Africa to determine if VIM-1-producing K. pneumoniae are present in significant numbers.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».