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Enregistrement W2051690406 · doi:10.1139/g04-018

Evolution of duplicated growth hormone genes in autotetraploid salmonid fishes

2004· article· en· W2051690406 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

venuePublié dans une revue dont le pays d'attache est le Canada.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueGenome · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAnimal Genetics and Reproduction
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGeneConcerted evolutionGeneticsPhylogenetic treeGene conversionEvolutionary biologyInheritance (genetic algorithm)Gene duplicationGenomeTroutFish <Actinopterygii>

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A defining character of the piscine family Salmonidae is autotetraploidy resulting from a genome-doubling event some 25-100 million years ago. Initially, duplicated genes may have undergone concerted evolution and tetrasomic inheritance. Homeologous chromosomes eventually diverged and the resulting reduction in recombination and gene conversion between paralogous genes allowed the re-establishment of disomic inheritance. Among extant salmonine fishes (e.g. salmon, trout, char) the growth hormone (GH) gene is generally represented by two functional paralogs, GH1 and GH2. Sequence analyses of salmonid GH genes from species of subfamilies Coregoninae (whitefish, ciscos) and Salmoninae were used to examine the evolutionary history of the duplicated GH genes. Two divergent GH gene paralogs were also identified in Coregoninae, but they were not assignable to the GH1 and GH2 categories. The average sequence divergence between the coregonine GH genes was more than twofold lower than the corresponding divergence between the salmonine GH1 and GH2. Phylogenetic analysis of the coregonine GH paralogs did not resolve their relationship to the salmonine paralogs. These findings suggest that disomic inheritance of two GH genes was established by different mechanisms in these two subfamilies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,512
Score d'incertitude au seuil0,374

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle