Genomic signatures of selection in response to sulfate air pollution in natural populations of red spruce
Notice bibliographique
Résumé
Rapid environmental changes, such as anthropogenic air pollution, can create significant evolutionary pressures on populations, species and ecosystems. Evolutionary processes occurring in natural populations at very short time scales, especially in response to human-induced environmental changes, are not well understood. Confounding effects of geographic variation and demography cannot be easily separated from signatures of recent selection in natural populations. We investigated the genetic response of declining red spruce (Picea rubens) populations at high elevation sites in Southern Appalachians to anthropogenic sulfate depositions. Red spruce seedlings are more sensitive to drought and cold stresses elicited by exposure to anthropogenic sulphate air pollution, than old trees. Genetic variation in seedlings and young trees was significantly reduced in heavily polluted stands. Several candidate genes involved in cold acclimation and calcium metabolism demonstrated signatures of selection corresponding with sulfate pollution levels. SNP allele frequencies at one gene involved in calcium metabolism demonstrated directional selection in response to anthropogenic sulfate deposition in red spruce growing at severely polluted high elevation sites, which corresponds well with the putative role of this gene in adaptation to acidification stress. Unlike range-wide experimental designs (e.g. the popular FST outlier test) and nucleotide diversity-based association studies, our within-population testing approach disentangled the confounding effects of geographic variation and demography from the genetic effects of recent selection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».