MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2051815912 · doi:10.1002/ajmg.a.36950

Anticipation in myotonic dystrophy type 1 parents with small CTG expansions

2015· article· en· W2051815912 sur OpenAlexafffundabout
Annabelle Pratte, Claude Prévost, Jack Puymirat, Jean Mathieu

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part A · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueGenetic Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensUniversité de SherbrookeCentre hospitalier de l'Université LavalCégep de JonquièreCentre de Santé et de Services Sociaux de Chicoutimi
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanada Research ChairsMuscular Dystrophy Canada
Mots-clésMyotonic dystrophyAnticipation (artificial intelligence)Trinucleotide repeat expansionOffspringAsymptomaticGeneticsMyotoniaPhenotypeBiologyMedicinePediatricsInternal medicineAllelePregnancyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Myotonic dystrophy type 1 is the most common form of adult muscular dystrophy and has the world's highest prevalence in the Saguenay-Lac-St-Jean region, due to a founder effect. This autosomal dominant disorder results from an unstable CTG repeat expansion in DMPK. This region of Canada has had a family screening and predictive testing program for this disorder since 1988. Heterozygotes for small expansions (50-100 CTG repeats) can be asymptomatic or minimally affected. The aim of this study was to assess anticipation for these individuals. At the time of this study, the molecular data of 40 individuals and their 76 affected children were available. We compared 76 parent-child pairs. Most offspring (92.1%) had a larger number of repeats than their parent and the median number of repeats in the offspring was 325 (range, 57-2000). The number of CTG repeats was significantly greater when the mutation was transmitted by a father (median, 425 repeats; range, 70-2000), than when it was transmitted by a mother (median, 200 repeats; range, 57-1400). The majority (65.8%) of children also had a more severe phenotype than their parent but the sex of the parent had no significant influence on the severity of the child's phenotype. No congenital phenotype was observed. These results confirm that anticipation is present even when the parent is heterozygous for a small CTG expansion. The parental sex has an impact on the size of the repeat in the next generation, larger increases being transmitted by males with a small expansion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,084
Tête enseignante GPT0,329
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2015
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAmerican Journal of Medical Genetics Part AMême sujetGenetic Neurodegenerative DiseasesTravaux en français237 207