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Enregistrement W2051869227 · doi:10.1186/1471-2199-11-92

Rrd1 isomerizes RNA polymerase II in response to rapamycin

2010· article· en· W2051869227 sur OpenAlex
Nathalie Jouvet, Jérémie Poschmann, Julie Douville, Lisa Bulet, Dindial Ramotar

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueBMC Molecular Biology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Chromatin Dynamics
Établissements canadiensUniversité de MontréalHôpital Maisonneuve-Rosemont
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésRNA polymerase IIBiologyChromatinPolymeraseRNA polymerase ITranscription (linguistics)RNA polymeraseTranscription factor II DCell biologyMolecular biologyRNARNA-dependent RNA polymeraseBiochemistryGeneGene expressionPromoter

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: In Saccharomyces cerevisiae, the immunosuppressant rapamycin engenders a profound modification in the transcriptional profile leading to growth arrest. Mutants devoid of Rrd1, a protein possessing in vitro peptidyl prolyl cis/trans isomerase activity, display striking resistance to the drug, although how Rrd1 activity is linked to the biological responses has not been elucidated. RESULTS: We now provide evidence that Rrd1 is associated with the chromatin and it interacts with RNA polymerase II. Circular dichroism revealed that Rrd1 mediates structural changes onto the C-terminal domain (CTD) of the large subunit of RNA polymerase II (Rpb1) in response to rapamycin, although this appears to be independent of the overall phosphorylation status of the CTD. In vitro experiments, showed that recombinant Rrd1 directly isomerizes purified GST-CTD and that it releases RNA polymerase II from the chromatin. Consistent with this, we demonstrated that Rrd1 is required to alter RNA polymerase II occupancy on rapamycin responsive genes. CONCLUSION: We propose as a mechanism, that upon rapamycin exposure Rrd1 isomerizes Rpb1 to promote its dissociation from the chromatin in order to modulate transcription.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil0,987

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle