HLA class I alleles tag <i>HLA-DRB1</i> * <i>1501</i> haplotypes for differential risk in multiple sclerosis susceptibility
Notice bibliographique
Résumé
The major locus for multiple sclerosis (MS) susceptibility is located within the class II region of the Major Histocompatibility Complex (MHC). HLA-DRB1 alleles, constituting the strongest MS susceptibility factors, have been widely exploited in research including construction of transgenic animal models of MS. Many studies have concluded that HLA-DRB1*15 allele itself determines MS-associated susceptibility. If this were true, haplotypes bearing this allele would confer equal risk. If HLA-DRB1*15 bearing haplotypes differed for risk, roles for other loci in this region would be implied and further study of the fine structure of this locus would be compelling. We have tested the hypothesis comparing haplotypes stratified by HLA class I tagging. We show here that HLA-DRB1*15-bearing-haplotypes in 1970 individuals from 494 MS families are indeed heterogeneous. Some HLA-DRB1*15 haplotypes determine susceptibility while others do not. Three groups of class I tagged HLA-DRB1*15 haplotypes were not over-transmitted: (i) HLA-DRB1*15-HLA-B*08 (TR = 25, NT = 23, Odds Ratio = 1.09), (ii) -HLA-B*27 (TR = 18, NT = 17, Odds Ratio = 1.06), and (iii) rare HLA-DRB1*15 haplotypes (frequency <0.02). Rare haplotypes were significantly different from common haplotypes, and transmissions were remarkably similar to those for class-I-matched non-HLA-DRB1*15 haplotypes. These results unambiguously indicate that HLA-DRB1*15 is part of a susceptibility haplotype but cannot be the susceptibility allele itself, requiring either epistatic interactions, epigenetic modifications on some haplotypes, or nearby structural variation. These findings strongly imply that differences among HLA-DRB1*15 haplotypes will furnish the basis for MHC-associated susceptibility in MS and raise the possibility that the MHC haplotype is the fundamental unit of genetic control of immune response.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,003 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».