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Enregistrement W2052004153 · doi:10.1094/mpmi-06-14-0168-r

Exopolysaccharide Production in Response to Medium Acidification Is Correlated With an Increase in Competition for Nodule Occupancy

2014· article· en· W2052004153 sur OpenAlexaff
Barney A. Geddes, Juan E. González, Ivan J. Oresnik

Notice bibliographique

RevueMolecular Plant-Microbe Interactions · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensIron Ore Company (Canada)University of Manitoba
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical Sciences
Mots-clésCompetition (biology)OccupancyNodule (geology)Production (economics)ChemistryBiologyEcologyEconomicsMicroeconomics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sinorhizobium meliloti strains unable to utilize galactose as a sole carbon source, due to mutations in the De-Ley Doudoroff pathway (dgoK), were previously shown to be more competitive for nodule occupancy. In this work, we show that strains carrying this mutation have galactose-dependent exopolysaccharide (EPS) phenotypes that were manifested as aberrant Calcofluor staining as well as decreased mucoidy when in an expR(+) genetic background. The aberrant Calcofluor staining was correlated with changes in the pH of the growth medium. Strains carrying dgoK mutations were subsequently demonstrated to show earlier acidification of their growth medium that was correlated with an increase expression of genes associated with succinoglycan biosynthesis as well as increased accumulation of high and low molecular weight EPS in the medium. In addition, it was shown that the acidification of the medium was dependent on the inability of S. meliloti strains to initiate the catabolism of galactose. To more fully understand why strains carrying the dgoK allele were more competitive for nodule occupancy, early nodulation phenotypes were investigated. It was found that strains carrying the dgoK allele had a faster rate of nodulation. In addition, nodule competition experiments using genetic backgrounds unable to synthesize either succinoglycan or EPSII were consistent with the hypothesis that the increased competition phenotype was dependent upon the synthesis of succinoglycan. Fluorescent microscopy experiments on infected root-hair cells, using the acidotropic dye Lysotracker Red DND-99, provide evidence that the colonized curled root hair is an acidic compartment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,063
Score d'incertitude au seuil0,473

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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