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Enregistrement W2052046366 · doi:10.1055/s-0029-1216352

Evidence for Interaction between<i>PPARG</i>Pro12Ala and<i>PPARGC1A</i>Gly482Ser Polymorphisms in Determining Type 2 Diabetes Intermediate Phenotypes in Overweight Subjects

2009· article· en· W2052046366 sur OpenAlexafffund
Stéphanie-May Ruchat, S. John Weisnagel, Marie‐Claude Vohl, T Rankinen, Claude Bouchard, Louis Përusse

Notice bibliographique

RevueExperimental and Clinical Endocrinology & Diabetes · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePeroxisome Proliferator-Activated Receptors
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésPeroxisome proliferator-activated receptor gammaPPARGC1AInternal medicineEndocrinologySingle-nucleotide polymorphismType 2 diabetesDiabetes mellitusInsulin resistanceMedicineGenotypeBiologyGeneticsPeroxisome proliferator-activated receptorGeneReceptorTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The peroxisome proliferator-activated receptor-gamma ( PPARG) Pro12Ala and the PPARG co-activator-1alpha ( PPARGC1A) Gly482Ser polymorphisms (SNPs) have been associated with type 2 diabetes mellitus (T2DM) risk. We hypothesized that independent and interactive effects of the PPARG Pro12Ala and PPARGC1A Gly482Ser polymorphisms influence T2DM intermediate phenotypes. MATERIAL AND METHODS: PPARG Pro12Ala and PPARGC1A Gly482Ser SNPs were studied in 680 non diabetic subjects who underwent a 75 g oral glucose tolerant test (OGTT). Glucose and insulin plasma levels in the fasting state and derived from the OGTT were included in the present study. RESULTS: We found significant independent effects of the PPARG and PPARGC1A variants on fasting insulin levels (p=0.02 for both), HOMA-IR (p=0.03 and p=0.02, respectively), insulin area under the curve (AUC) (p=0.007 and p=0.006, respectively) and 2-h glucose levels (p=0.02 for PPARGC1A). Furthermore, significant gene-gene interactions were found for fasting insulin, HOMA-IR and insulin AUC (p=0.03 for all). Carriers of the PPARGC1A Gly allele who were also PPARG Ala-carriers had higher fasting insulin levels (p=0.02), HOMA-IR (p=0.01) and insulin AUC (p=0.01) compared to the Ser/Ser-Ala+genotype combination, whereas no differences between the PPARGC1A genotypes among the PPARG Pro/Pro carriers were observed. CONCLUSION: Together, these results showed that PPARG Pro12Ala and PPARGC1A Gly482Ser variants are associated, alone and in interaction, with insulin and glucose homeostasis and suggest that gene-gene interactions should be taken into account in candidate gene studies of T2DM to identify subjects with markedly different risks of developing the disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,348
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,352
Écart entre enseignants0,313 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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