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Enregistrement W2052126154 · doi:10.1136/jmg.2006.043133

<i>CDH1</i>/E-cadherin germline mutations in early-onset gastric cancer

2006· letter· en· W2052126154 sur OpenAlexafffundabout
Julinor Bacani, Marcus Alvarenga Soares, Rhonda Zwingerman, Nando Di Nicola, Janine Senz, Robert H. Riddell, David G. Huntsman, Steven Gallinger

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Genetics · 2006
Typeletter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueWnt/β-catenin signaling in development and cancer
Établissements canadiensUniversity of TorontoCentre for Advancing Health OutcomesSt. Paul's HospitalMount Sinai HospitalVancouver General HospitalLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteUniversity of British ColumbiaUniversity of TorontoTerry Fox Foundation
Mots-clésGermline mutationGermlineCancerCDH1GeneticsPopulationBiologyMutationCancer researchMedicineCadherinGeneCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Gastric cancer remains a leading cause of cancer deaths worldwide. Genetic factors, including germline mutations in E-cadherin (CDH1, MIM#192090) in hereditary diffuse gastric cancer (HDGC, MIM#137215), are implicated in this disease. Family studies have reported CDH1 germline mutations in HDGC but the role of CDH1 germline mutations in the general population remains unclear. AIMS: To examine the frequency of CDH1 germline mutations in a population-based series of early-onset gastric cancer (EOGC <50 years old). METHODS: 211 cases of EOGC were identified in Central-East Ontario region from 1989 to 1993, with archival material and histological confirmation of non-intestinal type gastric cancer available for 81 subjects. Eligible cases were analysed for CDH1 germline mutations by single-strand conformation polymorphism, variants were sequenced, and tumours from cases with functional mutations were stained for E-cadherin (HECD-1) using immunohistochemistry. RESULTS: 1155 (89%) of 1296 polymerase chain reactions amplified successfully. One new germline deletion (nt41delT) was identified in a 30-year-old patient with isolated cell gastric cancer. The overall frequency of germline CDH1 mutations was 1.3% (1/81) for EOGC and 2.8% (1/36) for early-onset isolated cell gastric cancer. CONCLUSION: This is the first population-based study, in a low-incidence region, of genetic predisposition to gastric cancer. Combined with our previous report of germline hMLH1 mutations in two other subjects from this series, it is suggested that 2-3% of EOCG cases in North Americans may be owing to high-risk genetic mutations. These data should inform cancer geneticists on the utility of searching for specific genetic mutations in EOGC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,531
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations61
Publié2006
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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