Association Between the Various Mutations in Viral Core Promoter Region to Different Stages of Hepatitis B, Ranging of Asymptomatic Carrier State to Hepatocellular Carcinoma
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: The objective of this study was to determine the association of 19 mutations with frequencies ≥ 10% in the core promoter region of hepatitis B virus (HBV) with chronic hepatitis B (CHB), liver cirrhosis, and hepatocellular carcinoma (HCC). METHODS: Eight hundred forty-six asymptomatic hepatitis B surface antigen carriers (ASCs), 235 CHB patients, 188 cirrhosis patients, and 190 HCC patients with intact data of HBV genotyping, DNA sequencing, and serological parameters were studied. Nucleotides with the highest frequencies in HBV genotypes B and C from all ASCs were treated as wild-type nucleotides. RESULTS: Mutations at nt.1674, nt.1719, nt.1762, nt.1764, nt.1846, nt.1896, and nt.1913 in genotype C were significantly associated with CHB, cirrhosis, and HCC, as compared with ASCs. C1673T, A1726C, A1727T, C1730G, C1766T, T1768A, C1773T, and C1799G in genotype C were significantly associated with cirrhosis compared with the CHB patients, whereas these mutations were inversely associated with HCC compared with the cirrhosis patients. Multivariate regression analyses showed that age, male, abnormal alanine aminotransferase (ALT), T1768A, A1762T/G1764A, and A1846T were independently associated with cirrhosis compared with ASCs and the patients with CHB. Age, abnormal ALT, HBV DNA (≥10(4) copies/ml), genotype C, C1653T, T1674C/G, T1753V, and A1762T/G1764A were independently associated with HCC compared with those without HCC. Haplotypic carriages with two or more HBV mutations were significantly associated with HCC. T1674C/G, C1653T, and T1753V were specific for HCC. A1762T/G1764A had a moderate sensitivity and specificity for HCC. CONCLUSIONS: C1673T, A1726C, A1727T, C1730G, C1766T, T1768A, C1773T, and C1799G in genotype C are specific for cirrhosis. A1846T and T1674C/G are novel factors independently associated with cirrhosis and HCC, respectively.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».