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Enregistrement W2052320208 · doi:10.1158/0008-5472.can-11-3364

19p13.1 Is a Triple-Negative–Specific Breast Cancer Susceptibility Locus

2012· article· en· W2052320208 sur OpenAlexfundno aff
Kristen N. Stevens, Zachary Fredericksen, Celine M. Vachon, Xianshu Wang, Sara Margolin, Annika Lindblom, Heli Nevanlinna, Dario Greco, Kristiina Aittomäki, Carl Blomqvist, Jenny Chang‐Claude, Alina Vrieling, Dieter Flesch‐Janys, Hans‐Peter Sinn, Shan Wang‐Gohrke, Stefan Nickels, Hiltrud Brauch, Yon‐Dschun Ko, Hans‐Peter Fischer, Rita K. Schmutzler, Claus R. Bartram, Sarah Schott, Christoph Engel, Andrew K. Godwin, JoEllen Weaver, Harsh B. Pathak, Priyanka Sharma, Hermann Brenner, Heiko Müller, Volker Arndt, Christa Stegmaier, Penelope Miron, Drakoulis Yannoukakos, Alexandra Stavropoulou, George Fountzilas, Helen Gogas, Ruth Swann, Miriam Dwek, Annie Perkins, Roger L. Milne, Javier Benı́tez, María Pilar Zamora, José Ignacio Arias Pérez, Stig E. Bojesen, Sune F. Nielsen, Børge G. Nordestgaard, Henrik Flyger, Pascal Guénel, Thérèse Truong, F. Ménégaux, Emilie Cordina‐Duverger, Barbara Burwinkel, Frederick Marmé, Andreas Schneeweiß, Christof Sohn, Elinor J. Sawyer, Ian Tomlinson, Michael J. Kerin, Julian Peto, Nichola Johnson, Olivia Fletcher, Isabel dos‐Santos‐Silva, Peter A. Fasching, Matthias W. Beckmann, Arndt Hartmann, Arif B. Ekici, Artitaya Lophatananon, Kenneth Muir, Puttisak Puttawibul, Surapon Wiangnon, Marjanka K. Schmidt, Annegien Broeks, Linde M. Braaf, Efraim H. Rosenberg, John L. Hopper, Carmel Apicella, Daniel J. Park, Melissa C. Southey, Anthony J. Swerdlow, Alan Ashworth, Minouk J. Schoemaker, Hoda Anton‐Culver, Argyrios Ziogas, Leslie Bernstein, Christina Clarke Dur, Chen‐Yang Shen, Jyh-Cherng Yu, Huan-Ming Hsu, Chia‐Ni Hsiung, Ute Hamann, Thomas Dünnebier, Thomas Rüdiger, Hans Ulrich Ulmer, Paul D.P. Pharoah, Alison M. Dunning, Manjeet K. Humphreys, Qin Wang, Angela Cox, Simon S. Cross, Malcolm Reed, Per Hall, Kamila Czene, Christine B. Ambrosone, Foluso O. Ademuyiwa, Helena Hwang, Montserrat García‐Closas, Jonine D. Figueroa, Mark E. Sherman, Jolanta Lissowska, Peter Devilee, Caroline Seynaeve, Rob A.�E.�M. Tollenaar, Maartje J. Hooning, Irene L. Andrulis, Julia A. Knight, Gord Glendon, Anna Marie Mulligan, Robert Winqvist, Katri Pylkäs, Arja Jukkola‐Vuorinen, Mervi Grip, Esther M. John, Alexander Miron, Grethe Grenaker Alnæs, Vessela Kristensen, Anne‐Lise Børresen‐Dale, Graham G. Giles, Laura Baglietto, Catriona McLean, Gianluca Severi, Matthew L. Kosel, V.S. Pankratz, Susan Slager, Janet E. Olson, Paolo Radice, Paolo Peterlongo, Siranoush Manoukian, Monica Barile, Diether Lambrechts, Sigrid Hatse, Anne-Sophie Dieudonné, Marie-Rose Christiaens, Georgia Chenevix‐Trench, Jonathan Beesley, Veli‐Matti Kosma, Jaana M. Hartikainen, Ylermi Soini, Douglas F. Easton, Fergus J. Couch

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBiocenter, University of OuluMedical Research CouncilDeutsche Gesetzliche UnfallversicherungNational Institutes of HealthOulun YliopistoDeutsche KrebshilfeNational Cancer InstituteKuopion Yliopistollinen SairaalaBreast Cancer Research TrustBreast Cancer CampaignNational Health and Medical Research CouncilWellcome TrustCancer Research UKBundesministerium für Bildung und ForschungNational Institute for Health and Care ResearchItä-Suomen YliopistoLon V. Smith FoundationDeutsches KrebsforschungszentrumRobert Bosch StiftungHelsingin ja Uudenmaan SairaanhoitopiiriRoswell Park Cancer InstituteCancer Care OntarioEuropean CommissionBreast Cancer Research FoundationAmerican Association for Cancer Research
Mots-clésTriple-negative breast cancerBreast cancerLocus (genetics)Triple negativeOncologyMedicineInternal medicineCancerGeneticsBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The 19p13.1 breast cancer susceptibility locus is a modifier of breast cancer risk in BRCA1 mutation carriers and is also associated with the risk of ovarian cancer. Here, we investigated 19p13.1 variation and risk of breast cancer subtypes, defined by estrogen receptor (ER), progesterone receptor (PR), and human epidermal growth factor receptor-2 (HER2) status, using 48,869 breast cancer cases and 49,787 controls from the Breast Cancer Association Consortium (BCAC). Variants from 19p13.1 were not associated with breast cancer overall or with ER-positive breast cancer but were significantly associated with ER-negative breast cancer risk [rs8170 OR, 1.10; 95% confidence interval (CI), 1.05-1.15; P = 3.49 × 10(-5)] and triple-negative (ER-, PR-, and HER2-negative) breast cancer (rs8170: OR, 1.22; 95% CI, 1.13-1.31; P = 2.22 × 10(-7)). However, rs8170 was no longer associated with ER-negative breast cancer risk when triple-negative cases were excluded (OR, 0.98; 95% CI, 0.89-1.07; P = 0.62). In addition, a combined analysis of triple-negative cases from BCAC and the Triple Negative Breast Cancer Consortium (TNBCC; N = 3,566) identified a genome-wide significant association between rs8170 and triple-negative breast cancer risk (OR, 1.25; 95% CI, 1.18-1.33; P = 3.31 × 10(-13)]. Thus, 19p13.1 is the first triple-negative-specific breast cancer risk locus and the first locus specific to a histologic subtype defined by ER, PR, and HER2 to be identified. These findings provide convincing evidence that genetic susceptibility to breast cancer varies by tumor subtype and that triple-negative tumors and other subtypes likely arise through distinct etiologic pathways.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,065
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,061
Tête enseignante GPT0,387
Écart entre enseignants0,326 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations107
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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