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Enregistrement W2052389749 · doi:10.3109/03009742.2013.779021

Expression of human endogenous retrovirus HERV-K18 is associated with clinical severity in osteoarthritis patients

2013· article· en· W2052389749 sur OpenAlexaboutno aff
Marta García‐Montojo, Jezabel Varadé, E. Villafuertes, Belén de la Hera, J Hoyas-Fernandez, María Inmaculada Domínguez‐Mozo, Luis Rodríguez‐Rodríguez, Pilar Tornero-Esteban, Ana María Arias-Leal, Leticia León, José Ramón Lamas, Elena Urcelay, Benjamín Fernández‐Gutiérrez

Notice bibliographique

RevueScandinavian Journal of Rheumatology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueChromosomal and Genetic Variations
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineOsteoarthritisWOMACGenotypingTaqManInternal medicineReal-time polymerase chain reactionGenotypeOncologyPathologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: The aim of this study was to evaluate the involvement of human endogenous retrovirus K18 (HERV-K18) in osteoarthritis (OA), by genotyping the HERV-K18 env locus in OA patients and controls, and analysing HERV-K18 RNA expression and its association with OA risk and clinical variables. METHOD: We recruited 558 patients with symptomatic OA and 600 controls. We performed the genotyping by TaqMan assays and the analysis of expression by quantitative real-time polymerase chain reaction (qRT-PCR). Scores on the Western Ontario and McMasters Universities Osteoarthritis Index (WOMAC), the Lequesne index, and the Stanford Health Assessment Questionnaire (HAQ) were analysed with regard to the expression levels of HERV-K18. RESULTS: The 18.3 haplotype tended towards an association with OA risk and concordantly this haplotype was associated with a higher HERV-K18 expression (p = 0.05). We found statistically significant differences when we compared the scores on the WOMAC, the Lequesne index for knee and hip, and the HAQ between OA patients with higher expression [normalization ratio (NR) > 10] and OA patients without HERV-K18 expression (p = 0.0003, 0.0005, 0.002, and 0.05, respectively), and also when the comparison was made between OA patients with higher expression (NR > 10) and OA patients with low expression of HERV-K18 (NR = 1) for the WOMAC and the Lequesne index for knee and hip (p = 0.002, 0.013, and 0.006, respectively). CONCLUSIONS: We found an association between health status measurement systems and severity index for OA and the levels of expression of HERV-K18. These results suggest the possible involvement of HERV-K18 in the aetiopathogenesis of the disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,861

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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