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Enregistrement W2052506850 · doi:10.1002/dvdy.10122

TnIfast IRE enhancer: Multistep developmental regulation during skeletal muscle fiber type differentiation

2002· article· en· W2052506850 sur OpenAlexafffund
Patricia L. Hallauer, Kenneth E.M. Hastings

Notice bibliographique

RevueDevelopmental Dynamics · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle Physiology and Disorders
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMedical Research Council CanadaMcGill University
Mots-clésBiologyEnhancerTransgeneMyosinRegulation of gene expressionGene isoformGene expressionCell biologySkeletal muscleGenetically modified mouseReporter geneRegulatory sequenceGeneMolecular biologyGeneticsEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To identify developmental steps leading to adult skeletal muscle fiber-type-specific gene expression, we carried out transgenic mouse studies of the IRE enhancer of the quail TnIfast gene. Histochemical analysis of IRE/herpesvirus tk promoter/beta-galactosidase reporter transgene expression in adult muscle directly demonstrated IRE-driven fast vs. slow fiber-type specificity, and IIB>IIX>IIA differential expression among the fast fiber types: patterns similar to those of native-promoter TnIfast constructs. These tissue- and cell-type specificities are autonomous to the IRE and do not depend on interactions with a muscle gene promoter. Developmental studies showed that the adult pattern of IRE-driven transgene expression emerges in three steps: (1) activation during the formation of primary embryonic (presumptive slow) muscle fibers; (2) activation, to markedly higher levels, during formation of secondary (presumptive fast) fibers, and (3) differential augmentation of expression during early postnatal maturation of the IIB, IIX, IIA fast fiber types. These results provide insight into the roles of gene activation and gene repression mechanisms in fiber-type specificity and can account for apparently disparate results obtained in previous studies of TnI isoform expression in development. Each of the three IRE-driven developmental steps is spatiotemporally associated with a different major regulatory event at the fast myosin heavy chain gene cluster, suggesting that diverse muscle gene families respond to common, or tightly integrated, regulatory signals during multiple steps of muscle fiber differentiation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,919
Score d'incertitude au seuil0,940

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,201
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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