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Enregistrement W2052515869 · doi:10.1167/iovs.03-0090

Identification and Analysis of a Novel Mutation in the FOXC1 Forkhead Domain

2003· article· en· W2052515869 sur OpenAlex
Ramsey A. Saleem, Tara Murphy, Jeffery Liebmann, Michael A. Walter

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueInvestigative Ophthalmology & Visual Science · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFOXO transcription factor regulation
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMissense mutationBiologyMutationGeneticsMutagenesisProbandPhenotypeTransactivationGeneTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: To determine the genetic and biochemical defects that underlie Axenfeld-Rieger malformations, identify the pathogenic mutation causing these malformations, and understand how these mutations alter protein function. METHODS: FOXC1 was amplified from a proband with Axenfeld-Rieger malformations and the proband's mother. PCR products were sequenced to identify the pathogenic mutation. Site-directed mutagenesis was used to introduce this mutation into the FOXC1 cDNA. A synthetic mutation at the same position was also introduced, and both natural and synthetic proteins were tested for their ability to localize to the nucleus, bind DNA, and transactivate gene expression. RESULTS: A novel missense mutation (L86F) was identified in FOXC1 in this family. The mutation is located in alpha-helix 1 of the forkhead domain. Biochemical assays showed that the L86F mutation does not affect nuclear localization of FOXC1, but reduces DNA binding and significantly reduces transactivation. The severity of the disruption to FOXC1 protein activity does not appear to correspond well with the severity of the phenotype in the patient. Analogous studies using a L86P, a known alpha-helix breaker, severely disrupts FOXC1 function, revealing the importance of helix 1 in FOXC1 structure and function. CONCLUSIONS: A novel mutation in helix 1 of the FOXC1 forkhead domain has been identified and the importance of position 86 in FOXC1 activity demonstrated. These studies also identified the role of helix 1 in FOXC1 function and provide further evidence for the lack of strong genotype-phenotype correlation in FOXC1 pathogenesis. Normal development appears to be dependent on tight upper and lower thresholds of FOXC1 activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,517
Score d'incertitude au seuil0,582

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,337
Écart entre enseignants0,301 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle