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Enregistrement W2052628487 · doi:10.1080/03601234.2011.586598

Investigation on gene transfer from genetically modified corn (<i>Zea mays</i>L.) plants to soil bacteria

2011· article· en· W2052628487 sur OpenAlexafffund
Bharath Kumar L, Robert E. Blackshaw, Julie Roy, Tianpei He

Notice bibliographique

RevueJournal of Environmental Science and Health Part B · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensEnvironment and Climate Change CanadaAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of Guelph
Mots-clésKanamycinBiologyBacteriaNeomycinPopulationGeneGenetically modified organismMicrobiologyBotanyGeneticsAntibiotics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Knowledge about the prevalence and diversity of antibiotic resistance genes in soil bacteria communities is required to evaluate the possibility and ecological consequences of the transfer of these genes carried by genetically modified (GM) plants to soil bacteria. The neomycin phosphotransferase gene (nptII) conferring resistance to kanamycin and neomycin is one of the antibiotic resistance genes commonly present in GM plants. In this study, we investigated kanamycin-resistant (Km(R)) and neomycin-resistant (Nm(R)) soil bacterial populations in a 3-year field trial using a commercial GM corn (Zea mays L.) carrying the nptII gene and its near isogenic line. The results showed that a portion (2.3 - 15.6 %) of cultivable soil bacteria was naturally resistant to kanamycin or neomycin. However, no significant difference in the population level of Km(R) or Nm(R) soil bacteria was observed between the GM and non-GM corn fields. The nptII gene was not detected in any of the total 3000 Km(R) or Nm(R) isolates screened by PCR. Further, total soil bacterial cells were collected through Nycodenz gradient centrifugation and bacterial community DNA was subjected to PCR. Detection limit was about 500 cells per gram of fresh soil. Our study suggests that the nptII gene was relatively rare in the soil bacterial populations and there was no evidence of gene transfer from a GM corn plant to soil bacteria based on the data from total soil bacterial communities.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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