Jonquetella anthropi gen. nov., sp. nov., the first member of the candidate phylum ‘Synergistetes’ isolated from man
Notice bibliographique
Résumé
Six clinical isolates of a hitherto unknown, strictly anaerobic, Gram-negative rod showing fastidious growth were subjected to a polyphasic taxonomic study, including phenotypic, genomic and phylogenetic feature analyses. 16S rRNA gene sequenced-based phylogeny revealed that the novel strains represent a homogeneous group distant from any recognized species in the candidate phylum 'Synergistetes'. The novel isolates were most closely related to species of the genus Dethiosulfovibrio, with 88.2-88.7 % 16S rRNA gene sequence similarity. Large-scale chromosome structure and DNA G+C content also differentiated the novel strains from members of the genus Dethiosulfovibrio. The novel strains were asaccharolytic. Major metabolic end products in trypticase/glucose/yeast extract broth were acetic, lactic, succinic and isovaleric acids and the major cellular fatty acids iso-C(15 : 0) and C(16 : 0). Based on the data presented here, a new genus, Jonquetella gen. nov., is proposed with one novel species, Jonquetella anthropi sp. nov. J. anthropi is the first characterized species of the candidate phylum 'Synergistetes' that includes human isolates. The G+C content of the DNA of the type strain of J. anthropi ADV 126(T) (=AIP 136.05(T)=CIP 109408(T)=CCUG 53819(T)) is 59.4 mol%.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».