MétaCan
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Enregistrement W2052730689 · doi:10.3109/19401736.2013.840601

The complete mitochondrial genome sequence of the Canada goose (<i>Branta canadensis</i>)

2013· article· en· W2052730689 sur OpenAlexaboutno aff
Joshua C. Snyder, Craig Andrew Mackaness, Megan R. Sopher, Jonathan Huber, Edward J. Disantis, Andrew J. Senecal, Byron P. Vaughn, Robert S. Desantis, Page E. Tobelmann, Natalie M. Hecht Balauff, Patrick M. Barry, Matthew D. Show, Leann Speering, Christina A. Genareo, Frederic J. Brenner, Durwood B. Ray

Notice bibliographique

RevueMitochondrial DNA · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Phylogenetic Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMitochondrial DNABiologyGeneticsStart codonGooseGeneBrantaStop codonGenomeGenBankEcologyBase sequence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Canada goose (Branta canadensis) entire mitochondrial genome of a bird from Western Pennsylvania has 16,760 bp (GenBank accession number NC 007011) and has been analyzed for gene locations, length, start codon and stop codons. This genome from a bird harvested during the non-migratory season is the REFSEQ and the haplotype is designated GCC-A. There are two rRNAs, 22 tRNAs, 13 protein-coding regions, and 1 displacement loop region. The base composition of mtDNA was A (30.2%), G (15.1%), C (32.1%), and T (22.6%), so the percentage of A and T (52.8%) was slightly higher than G and C. All genes except ND6 and eight tRNA genes (Gln, Ala, Asn, Cys, Tyr, Ser, Pro and Glu) are encoded on the heavy strand. The gene arrangement is the same as most birds and differs from mammals by an inversion of the mtDNA at the connection between the D-loop and the ND5 junctions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,253
Score d'incertitude au seuil0,503

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,200
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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