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Enregistrement W2052835529 · doi:10.1111/j.1574-695x.2007.00261.x

Capsule expression regulated by a two-component signal transduction system in<i>Streptococcus iniae</i>

2007· article· en· W2052835529 sur OpenAlexafffund
Shelly Bolotin, Jeffrey Fuller, Darrin J. Bast, Terry J. Beveridge, Joyce C. S. de Azavedo

Notice bibliographique

RevueFEMS Immunology & Medical Microbiology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueStreptococcal Infections and Treatments
Établissements canadiensMount Sinai HospitalUniversity of GuelphUniversity of Alberta HospitalAlberta Hospital EdmontonUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyMutantStreptococcus iniaeOperonResponse regulatorMolecular biologyVirulenceGeneHistidine kinaseTransposon mutagenesisTwo-component regulatory systemMicrobiologyGeneticsTransposable element

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Streptococcus iniae causes disease in fish and humans and the presence of capsule is associated with virulence. Tn917 transposon mutagenesis was performed to identify capsule-associated genes and a mutant was isolated, with an insertion in a genetic locus encoding a two-component signal transduction system (TCS), which we termed sivS/R. sivS and sivR encode a 506-amino-acid (aa) putative histidine kinase and a 223-aa putative response regulator, respectively. In order to investigate the role of sivS/R, a deletion-insertion mutant was constructed using a PCR ligation technique. Real-time PCR showed that transcription of cpsA, the first gene in the S. iniae capsule operon, was reduced in the mutant, indicating that sivS/R regulates expression of this gene at the transcriptional level. Whole human blood killing assays demonstrated that unlike the parent, the mutant was susceptible to phagocytosis. Transmission electron microscopy showed exopolysaccharide on the surface of the parent strain but not the mutant which showed aberrant asymmetric septae that resulted in clumps of abnormal-shaped cells. Exponential growth rates of the mutant and parent strain were similar, although the mutant exhibited a longer lag phase. We conclude that sivS/R regulates capsule expression, thus affecting the ability to evade phagocytosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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