Activity and conformational changes of horseradish peroxidase in trifluoroethanol
Notice bibliographique
Résumé
The effect of trifluoroethanol (TFE) on horseradish peroxidase (HRP) was determined using activity assay and spectral analysis including optical absorption, circular dichroism (CD), and intrinsic fluorescence. The enzyme activity increased nearly twofold after incubation with 5-25% (v/v) concentrations of TFE. At these TFE concentrations, the tertiary structure of the protein changed little, while small changes occurred at the active site. Further increases in the TFE concentration (25-40%) decreased the enzyme activity until at 40% TFE the enzyme was completely inactivated. The alpha-helix content of the protein increased at high TFE concentrations, while near-UV CD, Soret CD, and intrinsic fluorescence indicated that the tertiary structure was destroyed. Polyacrylamide gel electrophoresis results indicated that the surface charge of the enzyme was changed at TFE concentrations greater than 20%, and increasing concentrations of TFE reduced the enzyme molecular compactness. A scheme for the unfolding of HRP in TFE was suggested based on these results. The kinetics of absorption change at 403 nm in 40% TFE followed a two-phase course. Finally, HRP incubated with TFE was more sensitive to urea denaturation, which suggested that the main effect of TFE on HRP was the disruption of hydrophobic interactions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».