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Enregistrement W2053159643 · doi:10.1099/vir.0.017921-0

Differential importance of highly conserved residues in UL24 for herpes simplex virus 1 replication in vivo and reactivation

2010· article· en· W2053159643 sur OpenAlexafffund
Gabriel André Leiva‐Torres, Pierre-Alexandre Rochette, Angela Pearson

Notice bibliographique

RevueJournal of General Virology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHerpesvirus Infections and Treatments
Établissements canadiensArmand Frappier MuseumInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchHealth Research Foundation
Mots-clésBiologyHerpes simplex virusVirusMutantGeneVirologyIn vivoHerpesviridaePhenotypeViral replicationGeneticsMutationMolecular biologyViral disease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The UL24 gene of herpes simplex virus 1 (HSV-1) is widely conserved among all subfamilies of the Herpesviridae. It is one of only four HSV-1 genes for which mutations have been mapped that confer a syncytial plaque phenotype. In a mouse model of infection, UL24-deficient viruses exhibit reduced titres, particularly in neurons, and an apparent defect in reactivation from latency. There are several highly conserved residues in UL24; however, their importance in the role of UL24 in vivo is unknown. In this study, we compared virus strains with substitution mutations corresponding to the PD-(D/E)XK endonuclease motif of UL24 (vUL24-E99A/K101A) or a substitution of another highly conserved residue (vUL24-G121A). Both mutant viruses cause the formation of syncytial plaques at 39 degrees C; however, we found that the viruses differed dramatically when tested in a mouse model of infection. vUL24-E99A/K101A exhibited titres in the eye that were 10-fold lower than those of the wild-type virus KOS, and titres in trigeminal ganglia (TG) that were more than 2 log10 lower. Clinical signs were barely detectable with vUL24-E99A/K101A. Furthermore, the percentage of TG from which virus reactivated was also significantly lower for this mutant than for KOS. In contrast, vUL24-G121A behaved similarly to the wild-type virus in mice. These results are consistent with the endonuclease motif being important for the role of UL24 in vivo and also imply that the UL24 temperature-dependent syncytial plaque phenotype can be separated genetically from several in vivo phenotypes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Étiquettes directes de modèles (non validées)

Étiquettes de catégorie et de devis d'étude par modèle, issues des rondes d'étiquetage. C'est une sortie machine, non validée, et le désaccord entre modèles est livré comme donnée. Aucun devis ici n'est encore validé contre MEDLINE.

BrasCatégoriesDevis d'étudeConfiance
gemmaaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Expérimental (laboratoire)low
gptaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Expérimental (laboratoire)high
modèles en accordL'accord compare des ensembles de catégories et des devis identiques entre les bras.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,475
Score d'incertitude au seuil0,244

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,315
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Étiqueté directement par 2 modèles lisant le dossier complet.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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