Strategy for Analysis of Cardiac Troponins in Biological Samples with a Combination of Affinity Chromatography and Mass Spectrometry
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Cardiac troponins are modified during ischemic injury and are found as a heterogeneous mixture in blood of patients with cardiovascular diseases. We present a strategy to isolate cardiac troponins from human biological material, by use of affinity chromatography, and to provide samples ready for direct analysis by mass spectrometry. METHODS: Cardiac troponins were isolated from human left ventricular tissue by affinity chromatography. Isolated troponins were either eluted and analyzed by Western blot or enzymatically digested while bound to affinity beads. The resulting peptide mixture was subjected to mass spectrometry for protein identification and characterization. The same method was used to analyze serum from patients with acute myocardial infarction (AMI). RESULTS: Affinity chromatography with antibodies specific for one cardiac troponin subunit facilitated the isolation of the entire cardiac troponin complex from myocardial tissue. The three different proteases used for enzymatic digestion increased the total protein amino acid sequence coverage by mass spectrometry for the three cardiac troponin subunits. Combined amino acid sequence coverage for cardiac troponin I, T, and C (cTnI, cTnT, cTnC) was 54%, 48%, and 40%, respectively. To simulate matrix effects on the affinity chromatography-mass spectrometry approach, we diluted tissue homogenate in cardiac troponin-free serum. Sequence coverage in this case was 44%, 41%, and 19%, respectively. Finally, affinity chromatography-mass spectrometry analysis of AMI serum revealed the presence of cardiac troponins in a wide variety of its free and/or complexed subunits, including the binary cTnI-cTnC and cTnI-cTnC-cTnT complexes. CONCLUSIONS: Affinity chromatography-mass spectrometry allows the extraction and analysis of cardiac troponins from biological samples in their natural forms. We were, for the first time, able to directly confirm the presence of cardiac troponin complexes in human serum after AMI. This approach could assist in more personalized risk stratification as well as the search for reference materials for cardiac troponin diagnostics.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».