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Enregistrement W2053269801 · doi:10.1186/s13104-015-1049-4

Cyclooxygenase 1 mRNA expression is undetectable in Madin Darby Canine Kidney cells

2015· article· en· W2053269801 sur OpenAlexafffund
Guillaume Pelletier, Bhaja K. Padhi

Notice bibliographique

RevueBMC Research Notes · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInflammatory mediators and NSAID effects
Établissements canadiensHealth Canada
Organismes subventionnairesNatural Resources Canada
Mots-clésCyclooxygenaseCell cultureKidneyMessenger RNACell biologyGene expressionBiologyCancer researchMolecular biologyMedicineGeneInternal medicineEnzymeBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Madin Darby Canine Kidney (MDCK) cells form polarized epithelium in vitro and are routinely used in research fields ranging from protein trafficking to influenza. However, the canine origin of these cells also means that compared to man or mouse, genomic resources are more limited and performance of commercially available antibodies often untested. The synthesis of pro-inflammatory prostaglandins in the kidney is mediated by the constitutively expressed cyclooxygenase 1 and the inducible cyclooxygenase 2 (COX-1 and COX-2, respectively). There are conflicting reports on the expression of COX-1 and COX-2 in MDCK cells and this lingering uncertainty about such important pharmacological targets may affect the interpretation of results obtained from this cell line. RESULTS: In order to definitively settle the issue of cyclooxygenase expression in MDCK cells, we designed PCR primers based on dog genomic sequences to probe COX-1 and COX-2 mRNA expression in MDCK cells and dog kidney. We report that while COX-1 and COX-2 genes are both expressed in dog kidney, COX-1 expression is undetectable in MDCK cells. CONCLUSIONS: By improving the characterization of cyclooxygenase expression in MDCK cells, this study will contribute to a better understanding of the properties of this cell line and lead to improved experimental designs and data interpretations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,238
Score d'incertitude au seuil0,845

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,177
Tête enseignante GPT0,405
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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