Gene expression of the arsenic resistance operon in<i>Chromobacterium violaceum</i>ATCC 12472
Notice bibliographique
Résumé
Chromobacterium violaceum ATCC 12472 presents an arsRCB-type operon, which is involved in arsenic resistance. The regulating protein of this resistance system (ArsR) does not have the small conserved site (ELCVDCL) to link to the metalloid, as observed in Escherichia coli, and is thus considered to be an atypical ArsR protein, like that observed in Acidithiobacillus ferrooxidans. In the present study, the gene expression profile of the ars operon under induction at different concentrations of arsenite - As(III) - was obtained via real-time PCR (TaqMan), by correlating the threshold cycle (Ct) values of induced and uninduced (control) samples. Through linear regression analysis (R2 = 0.9926), the gene expression profile of the ars operon showed clearly that the 0.125 micromol/L concentration of As(III) was sufficient to provoke a 4-fold increase in the resistance system, and a further increase in concentration resulted in an increase of up to 53-fold in transcription rates. The relation between resistance and induction of the ars operon indicates that the increased resistance to As(III) is associated with the increase in the number of transcripts.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».