Signal sequence as a determinant in expressing disulfide-stabilized single chain antibody variable fragments (sc-dsFv) against human VEGF
Notice bibliographique
Résumé
Phage-displayed single chain variable fragment (scFv) libraries have been powerful tools in antibody engineering. But the scFv structures are frequently unstable due to the dissociation of the dimeric interface between the two variable domains. One solution is the sc-dsFv construct, where the single chain variable domain fragment is stabilized with an additional interface disulfide bond, leading to stable and homogeneous dimeric interface for the sc-dsFv structure. However, the phagemid system that is capable of effective expression for both sc-dsFv-pIII fusion proteins on phage surface and secreted non-fusion sc-dsFv in bacterial culture medium has not been demonstrated. In this work, a biological combinatorial approach was applied to optimize the signal sequence N-terminal to the sc-dsFv-pIII fusion protein encoded in a phagemid. The optimized sc-dsFv phage display systems were compatible with both the phage-based directed evolution procedure and the high throughput screening of the soluble sc-dsFv. The utility of the phagemid systems was demonstrated in generating anti-VEGF sc-dsFv with VEGF-binding affinity one order of magnitude higher than the corresponding scFv, due only to the interface disulfide bond in the sc-dsFv. Moreover, the protein stability of the sc-dsFv construct was unmatched by the corresponding scFv. These advantages of the sc-dsFv were gained through the interface disulfide bond of the sc-dsFv and the novel signal sequence in the phagemid.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».